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14APPENDIX
把名词钉住，把数字归档

术语表与关键数字

Glossary, key numbers, and where to read next.
OPTIMADE
材料数据库的统一 REST 协议：同一套过滤语法（如 elements HAS ALL "Si"）查多家库。本机五家材料库经它接入。
理论级别
一组计算的“配方”：方法、基组或截断能+赝势、色散校正、自旋处理、程序与版本。配方不同，能量不可直接比较或混训。
形成能
化合物相对其组成元素单质的能量，每原子归一（eV/atom）。MP 的形成能带 MP2020 兼容性校正，与原始总能量分开标注。
基组 / ECP
基组是波函数的展开基；ECP（有效核势）把重元素内层电子换成势。BSE（017）可编程取两者文本，重元素自动带 ECP。
QSAR
定量构效关系：用描述符从结构预测活性。ChEMBL 的人工标定活性数据是其金标准来源。
pLDDT
AlphaFold 的逐残基置信度（0–100）。低置信区是预测的无序区，不能当实验结构使用。
CC BY-SA
知识共享“署名—相同方式共享”许可（ChEMBL 数据为 CC BY-SA 3.0）：可用可改，但衍生作品须同许可发布，与 CC-BY 不可混为一谈。

关键数字与出处

数字含义出处
103 / 11收录资源数 / 类别数原册目录，链接核验 2026-10-27
38395 → 25384NOMAD 中 Si 条目总数 → 加周期性过滤后本机实测 2026-10-27（见第 12 章）
13阿司匹林在 ChEMBL molfile 中的重原子数（C9H8O4）本机实测，CHEMBL25
58本机回归测试数（本次新增 10）chemdb-agent tests/，录制回放
502OQMD OPTIMADE 端点当前 HTTP 状态本机实测 2026-10-27

延伸阅读

  • OPTIMADE 规范与提供方索引：optimade.org —— 理解统一查询的过滤语法与字段定义。
  • Materials Project 文档与 mp-api：docs.materialsproject.org —— 形成能与 MP2020 校正的口径。
  • ChEMBL API 文档：www.ebi.ac.uk/chembl/api —— 过滤语法（如 pref_name__iexact）与许可说明。
  • NOMAD FAIR 数据说明：nomad-lab.eu —— 同一体系多来源计算的溯源方式。
后记

这本讲解版和以往不同：它讲解的对象在讲解当天被接进了本机代码。导航册回答“去哪找”，工程回答“找到了能不能用、用了合不合法、混起来会不会坏”。三问都答完，一条资源才算真正入册。