05DRUGS
计算化学数据库与资源导航 2026
药物、生物活性与化学空间
Drugs, bioactivity & chemical space
这一类的货币不是结构而是“活性”：ChEMBL 的 IC50/Ki 人工标定数据是 QSAR 的金标准，GDB 系列则定义了“化学空间有多大”这个问题的边界。
| 编号 | 资源 | 要点（据原文一句话定位） | 访问 | 本机接入 |
|---|---|---|---|---|
| 043 | ChEMBL www.ebi.ac.uk/chembl | EBI 的生物活性数据库，整合药物、靶点与测定数据，是药物机器学习首选。 | 免费 | ★适配器 |
| 044 | DrugBank go.drugbank.com | 药物与靶点知识库，含已上市及在研药物信息，学术访问免费。 | 学术免费 | |
| 045 | ZINC zinc.docking.org | 可购买化合物的虚拟筛选库，提供多种预处理格式与三维构象。 | 免费 | |
| 046 | Enamine REAL enamine.net/compound-collections/real-compounds | 超大规模可合成化合物库，适合按需订购与十亿级虚拟筛选。 | 商业 | |
| 047 | Guide to Pharmacology www.guidetopharmacology.org | IUPHAR 的受体、离子通道与配体数据库，人工注释质量高。 | 免费 | |
| 048 | DUDE-Z dudez.docking.org | 分子对接评测的诱饵分子集，用于检验虚拟筛选方法的富集能力。 | 免费 | |
| 049 | Tox21 tox21.gov | 美国联邦毒理研究计划数据门户，提供 21 世纪毒理学测试数据。 | 免费 | |
| 050 | EPA CompTox comptox.epa.gov/dashboard | 美国 EPA 化学品仪表盘，整合毒性、暴露与化学性质数据。 | 免费 | |
| 051 | ADMETlab 3.0 admetlab3.scbdd.com | 在线 ADMET 性质预测平台，输入 SMILES 即可获得成药性与安全性评估。 | 免费 | |
| 052 | Therapeutics Data Commons tdcommons.ai | 治疗数据共享平台，汇集药物发现相关的机器学习数据集与基准。 | 免费 |
讲解
ChEMBL（043，本机已新增适配器）：名称/SMILES/InChIKey 精确检索，返回 2D 重原子坐标与描述符，许可 CC BY-SA——注意它的坐标不含氢、不能直接当 3D 构象用，要 3D 去 PubChem 或自己做构象生成。ZINC（046）管“能买到的化合物”，Enamine（049）管按需合成空间；GDB-13/17（051/052）的 10⁹–10¹¹ 量级是给生成模型划边界用的，不是拿来逐个算的。