10SOFTWARE II
计算化学数据库与资源导航 2026
软件、平台与计算入口：工作流与工具
Workflows, viewers & utilities
090–099 是工作流与周边工具：输入生成、可视化、格式转换与后处理。它们的共同价值是降低“从结构到可跑的输入”之间的摩擦——多数返工都发生在这一步，而不是在求解器里。
| 编号 | 资源 | 要点（据原文一句话定位） | 访问 | 本机接入 |
|---|---|---|---|---|
| 090 | GROMACS www.gromacs.org | 开源生物分子分子动力学程序，性能与生态俱佳。 | 免费 | |
| 091 | OpenMM openmm.org | GPU 加速的分子动力学工具包，适合自定义力场与 Python 工作流。 | 免费 | |
| 092 | AutoDock Vina vina.scripps.edu | 开源分子对接程序，速度与精度平衡，常用于虚拟筛选与结合模式预测。 | 免费 | |
| 093 | RDKit www.rdkit.org | 开源化学信息学工具包，分子读写、描述符计算与构象生成必备。 | 免费 | |
| 094 | ASE ase-lib.org | 原子模拟环境，统一封装多种 DFT 与分子动力学程序，适合高通量筛选。 | 免费 | |
| 095 | AiiDA aiida.net | 材料计算工作流与数据管理平台，强调可复现性与数据溯源。 | 免费 | |
| 096 | Avogadro avogadro.cc | 跨平台分子建模与可视化工具，适合搭建与检查初始结构。 | 免费 | |
| 097 | MolSSI molssi.org | 分子科学软件研究所，提供软件、数据集、标准与培训资源。 | 免费 | |
| 098 | Multiwfn sobereva.com/multiwfn | 波函数分析与可视化程序，支持电子密度、EDA、NCI、激发态等分析，中文教程完善。 | 免费 | |
| 099 | Rowan rowansci.com | 云端量子化学平台，可通过网页或 API 提交任务，适合快速获得可靠性质。 | 商业 |
讲解
挑工具的标准只有一条：可脚本化。能被程序调用、能批量、能进版本管理的工具才配进自动化管线；只能点鼠标的查看器留给人工检查。本机管线内部用 ASE/pymatgen 做格式层，正是这一类的开源组合。若你新增一个工具，先问它能否无头运行、输出是否结构化——两个都是“否”，就只登记导航、不进管线。