计算化学数据库 · 88 条

数据快照日期 2026-10-27。只列标题、来源与短摘要，阅读全文请访问原站。也可以回到 统一搜索 按关键词筛选，或用 AI 助手带出处地提问。

数据库与平台 5

• Basis Set Exchange官方软件与数据库 / ChemDB Atlas

  The new Basis Set Exchange (BSE) for Quantum Chemistry

• NIST Chemistry WebBook官方软件与数据库 / ChemDB Atlas

  The NIST Chemistry WebBook provides users with easy access to chemical and physical property data for chemical species through the internet. The data provided in the site are from…

• CCCBDB官方软件与数据库 / ChemDB Atlas

  CCCBDB introduction navigation

• NOMAD官方软件与数据库 / ChemDB Atlas

  NOMAD

• Materials Cloud官方软件与数据库 / ChemDB Atlas

  Materials Cloud - Explore scientific datasets and tools

综合化合物与化学信息 6

• PubChemChemDB Atlas

  全球最大的公开化学信息库，可按名称、结构或 CAS 号检索化合物性质、生物活性与文献。

• ChemSpiderChemDB Atlas

  英国皇家化学会（RSC）维护的结构数据库，聚合数百万化合物的性质与外部来源链接。

• CAS Common ChemistryChemDB Atlas

  CAS 官方免费子库，适合用 CAS 号快速核对常用化学品的基础性质。

• ChEBIChemDB Atlas

  EBI 的化学本体数据库，提供化合物本体注释及其与生物医学实体的关联。

• ReaxysChemDB Atlas

  Elsevier 的反应与物质性质检索平台，支持逆合成分析与文献实验数据回溯。

• SciFinder-nChemDB Atlas

  CAS 旗舰检索平台，覆盖文献、物质、反应与专利，适合系统查新与专利检索。

量子化学基准与基础参数 10

• GMTKN55ChemDB Atlas

  Grimme 组的主族热化学与反应能基准集，DFT 方法评测的事实标准之一。

• Minnesota DatabasesChemDB Atlas

  Truhlar 组维护的多样基准库集合（M06、S22、MGCDB84 等），含几何与能量数据。

• ATcTChemDB Atlas

  Active Thermochemical Tables，通过网络化评估给出高精度生成焓与键能。

• NIST-JANAFChemDB Atlas

  经典热力学函数表，提供物质在宽温区内的 Cp、S、H 以及平衡常数。

• Burcat 热化学库ChemDB Atlas

  NASA 多项式热化学数据库，燃烧与反应机理建模的常用参数来源。

• ReSpecThChemDB Atlas

  燃烧反应机理与实验数据平台，含点火延迟、火焰速度等模型验证数据。

• NIST KineticsChemDB Atlas

  气相化学动力学实验数据检索库，可按反应物或产物查速率常数。

• IUPAC 气相动力学ChemDB Atlas

  IUPAC 气相动力学数据评估项目（现由 AERIS 托管），提供经评审的速率常数与光解数据。

• SSSPChemDB Atlas

  Materials Cloud 的标准固体赝势库，为可复现的固体 DFT 计算提供推荐设置。

• libxcChemDB Atlas

  开源交换-相关泛函库，被主流量化与固体电子结构程序广泛调用。

材料与晶体结构 13

• Materials ProjectChemDB Atlas

  美国能源部支持的 DFT 材料数据库，可检索结构、能带、相图与电池、催化性质。

• OQMDChemDB Atlas

  开放量子材料数据库，提供百万级无机化合物的形成能与结构稳定性数据。

• AFLOWChemDB Atlas

  高通量材料计算平台，提供结构原型、热力学与电子性质等大规模数据。

• JARVISChemDB Atlas

  NIST 的材料与分子数据平台，含 DFT 性质、力场与机器学习工具。

• C2DBChemDB Atlas

  二维材料计算数据库，提供数百种单层材料的结构稳定性与电子、磁性质。

• ICSDChemDB Atlas

  无机晶体结构数据库，收录实验测定的晶体结构，通常需机构订阅。

• Cambridge Structural DatabaseChemDB Atlas

  剑桥结构数据库（CSD），有机与金属有机晶体结构的权威来源。

• Crystallography Open DatabaseChemDB Atlas

  开放晶体学数据库，免费提供数十万条晶体结构 CIF 文件。

• AMCSDChemDB Atlas

  矿物与相关固体的晶体结构库，适合矿物学与地球化学研究。

• Bilbao Crystallographic ServerChemDB Atlas

  晶体学对称性服务器，可查空间群、不可约表示与相变对称性。

• Catalysis-HubChemDB Atlas

  催化表面吸附能与反应能数据库，汇总多个研究组的 DFT 计算结果。

• MatbenchChemDB Atlas

  材料机器学习基准套件，含 13 个性质预测任务与固定数据划分。

• Matbench DiscoveryChemDB Atlas

  材料发现专用基准，评估机器学习势函数在稳定材料筛选中的实际表现。

生物大分子与结构 8

• Protein Data BankChemDB Atlas

  实验测定的蛋白质与核酸三维结构总库，结构生物学与分子对接的起点。

• AlphaFold DBChemDB Atlas

  AlphaFold 预测的蛋白结构库，覆盖数百万物种的蛋白质组。

• EMDBChemDB Atlas

  冷冻电镜密度图数据库，与 PDB 中的原子模型互相补充。

• UniProtChemDB Atlas

  蛋白序列与功能注释的权威数据库，可直接下载 FASTA 用于建模。

• BMRBChemDB Atlas

  生物大分子核磁共振数据银行，收录化学位移、结构约束与弛豫数据。

• PDBbind+ChemDB Atlas

  蛋白-配体复合物结合亲和力数据集，广泛用于打分函数开发与机器学习训练。

• BindingDBChemDB Atlas

  公开的结合亲和力数据库，可按靶点或化合物检索 Ki、Kd 与 IC50。

• PLINDERChemDB Atlas

  大规模蛋白-配体相互作用数据集，提供高质量结构、界面标注与划分。

药物、生物活性与化学空间 10

• ChEMBLChemDB Atlas

  EBI 的生物活性数据库，整合药物、靶点与测定数据，是药物机器学习首选。

• DrugBankChemDB Atlas

  药物与靶点知识库，含已上市及在研药物信息，学术访问免费。

• ZINCChemDB Atlas

  可购买化合物的虚拟筛选库，提供多种预处理格式与三维构象。

• Enamine REALChemDB Atlas

  超大规模可合成化合物库，适合按需订购与十亿级虚拟筛选。

• Guide to PharmacologyChemDB Atlas

  IUPHAR 的受体、离子通道与配体数据库，人工注释质量高。

• DUDE-ZChemDB Atlas

  分子对接评测的诱饵分子集，用于检验虚拟筛选方法的富集能力。

• Tox21ChemDB Atlas

  美国联邦毒理研究计划数据门户，提供 21 世纪毒理学测试数据。

• EPA CompToxChemDB Atlas

  美国 EPA 化学品仪表盘，整合毒性、暴露与化学性质数据。

• ADMETlab 3.0ChemDB Atlas

  在线 ADMET 性质预测平台，输入 SMILES 即可获得成药性与安全性评估。

• Therapeutics Data CommonsChemDB Atlas

  治疗数据共享平台，汇集药物发现相关的机器学习数据集与基准。

代谢物、天然产物与质谱 4

• HMDBChemDB Atlas

  人类代谢组数据库，收录代谢物结构、浓度与疾病关联信息。

• METLINChemDB Atlas

  Scripps 的代谢物质谱数据库，支持 MS/MS 谱图匹配与代谢物鉴定。

• MassBankChemDB Atlas

  开放质谱数据库，汇总多台仪器的正、负离子实测谱图。

• COCONUTChemDB Atlas

  天然产物化学结构数据库，适合天然产物虚拟筛选与化学空间分析。

反应、合成与生化通路 6

• Open Reaction DatabaseChemDB Atlas

  开放反应数据库，标准化存储反应条件与实验结果，并提供 API。

• USPTO 反应数据集ChemDB Atlas

  Lowe 整理的美国专利反应数据（1976–2016），反应预测机器学习模型的经典训练集。

• Chemotion RepositoryChemDB Atlas

  开源电子实验记录与反应数据仓库，可发布可引用的实验数据集。

• RheaChemDB Atlas

  生化反应数据库，提供酶催化的反应方程式与层级分类。

• BRENDAChemDB Atlas

  酶功能与动力学数据库，含 Km、kcat、抑制剂与生物来源信息。

• KEGGChemDB Atlas

  京都基因与基因组百科，提供代谢通路、酶与化合物之间的关联。

光谱与波谱 6

• HITRANChemDB Atlas

  高分辨率分子光谱数据库，大气探测与燃烧诊断的标准谱线来源。

• ExoMolChemDB Atlas

  系外行星与高温分子谱线库，覆盖大量小分子的完整 rovibronic 谱线。

• JPL Molecular SpectroscopyChemDB Atlas

  JPL 微波、毫米波分子谱线目录，射电天文与气相光谱研究常用。

• CDMSChemDB Atlas

  科隆分子光谱数据库，提供气相分子的转动与振动谱线数据。

• SDBSChemDB Atlas

  日本 AIST 谱图数据库，可检索 IR、Raman、NMR 与 MS 实测谱。

• NIST Atomic Spectra DatabaseChemDB Atlas

  NIST 原子光谱数据库，提供原子能级、谱线与跃迁概率。

机器学习数据集与势函数 11

• QM9ChemDB Atlas

  13.4 万个小有机分子的量子化学性质（几何、能量、振动等），分子机器学习入门标配。

• QM7 / QM7b / MD17ChemDB Atlas

  经典分子机器学习数据集族，含库仑矩阵表示与分子动力学轨迹的能量、受力数据。

• ANI-1ChemDB Atlas

  约两千万个小分子构象的 DFT 能量数据集，ANI 系列机器学习势函数的训练基础。

• OC20 / OC22ChemDB Atlas

  Open Catalyst 项目的大规模催化表面吸附数据集，用于训练通用机器学习势函数。

• PubChemQCChemDB Atlas

  基于 PubChem 的大规模电子结构数据库，含 2.2 亿分子的 PM6 与 8600 万分子的 B3LYP 数据。

• AlexandriaChemDB Atlas

  百万级分子的 DFT 性质数据集，适合训练通用分子表示与性质预测模型。

• tmQMChemDB Atlas

  过渡金属配合物的量子化学数据集，填补有机分子数据集在金属化学上的空白。

• QCArchiveChemDB Atlas

  MolSSI 的量子化学计算数据平台，可检索、共享与复用计算结果。

• Open Graph BenchmarkChemDB Atlas

  图神经网络基准套件，包含分子图性质预测等任务与标准划分。

• DeepChem / MoleculeNetChemDB Atlas

  DeepChem 生态的分子机器学习数据集与 MoleculeNet 基准合集。

• NIST Interatomic PotentialsChemDB Atlas

  NIST 原子间势函数库，收录 EAM、MEAM 等经典势参数与评估工具。

软件、平台与计算入口 5

• Q-ChemChemDB Atlas

  商业量子化学程序，擅长激发态、溶剂化与高端电子结构方法。

• GAMESSChemDB Atlas

  经典开源量子化学程序，方法齐全、教程与社区资源丰富。

• AutoDock VinaChemDB Atlas

  开源分子对接程序，速度与精度平衡，常用于虚拟筛选与结合模式预测。

• MolSSIChemDB Atlas

  分子科学软件研究所，提供软件、数据集、标准与培训资源。

• RowanChemDB Atlas

  云端量子化学平台，可通过网页或 API 提交任务，适合快速获得可靠性质。

社区与中文入口 4

• 计算化学公社ChemDB Atlas

  中文计算化学社区，教程、答疑与软件资源丰富，适合入门与查错。

• Sobereva 思想家公社ChemDB Atlas

  Sobereva 的博客，含大量量子化学入门、Multiwfn 与实用技巧长文。

• X-MOLChemDB Atlas

  中文化学与材料文献平台，可跟踪期刊、主题与最新研究进展。

• CCLChemDB Atlas

  Computational Chemistry List，国际计算化学邮件列表与资源索引。

MolAstria 只做标题级聚合索引，版权归原作者与原站所有。