MOLASTRIA · ONLINE MODEL API
量子化学模型接口
站长电脑的 GPU 上部署了 15 个机器学习原子模型:Meta 的 UMA 和 OMol25 系列、MACE 系列和 ANI-2x;CPU 上还有开源半经验程序 xTB 的四种方法(GFN2-xTB、加水溶剂的 GFN2-xTB、GFN1-xTB、GFN-FF),以及跑蛋白质分子动力学的开源引擎 OpenMM。这里按模型类别分成六个窗口,不用安装任何东西,输入 SMILES、XYZ 结构或 PDB 编号就能在线计算。每个模型一次只给一个人算,其余按提交顺序排队;每人同时只能有一个任务。
注意:结果是机器学习势的预测,不是 DFT 计算。模型的误差随体系变化,重要的结论请用 DFT 或实验核对。
这里的模型预测原子体系的能量和力;处理科学文本和科学数据的语言模型(如 Hydrogen-1.0、Intern-S1)见科学大模型栏目和讲解手册的科学语言模型一章。
1 · 模型
直接受力型模型:它直接预测原子受力,力不是能量的导数,能量和力不严格守恒;频率由受力的有限差分得到,和能量守恒型模型相比误差更大。
2 · 结构
蛋白质的结构由站长电脑按右边的 PDB 编号从 RCSB 下载,不用另给。
图中的数字是原子编号(从 0 开始,按 SMILES 里的顺序);加氢后氢原子排在重原子后面。扫描、键解离能和质子亲和能按这些编号选原子或键。
反应计算的物种写在右边的反应 SMILES 里,不用另给结构。
3 · 计算
这个窗口的模型
训练数据的 DFT 水平决定了模型在学什么:同一个分子,不同模型的绝对能量不能直接比较,比较相对能量和趋势。
每日额度与计次
每项计算按花费扣次数;被拒绝的计算、站长电脑离线时的计算都不扣。次数每 24 小时重置。
| 模型 | 每天 |
|---|---|
| Meta 的 UMA 和 OMol25 模型(UMA、AllScAIP、eSEN)、ANI-2x、xTB 与 OpenMM | 共用:不登录 40 次,免费账号 100 次,Pro 支持者 200 次 |
| MACE 系列(学术许可) | 每位访客 40 次,对所有人相同 |
| 计算 | 消耗 |
|---|---|
| 单点、几何优化、电离能与电子亲和能、偶极矩与极化率 | 1 次 |
| 自旋态能隙、键解离能、质子亲和能 | 2 次(加热校正 5 次) |
| 振动频率与热化学、红外与拉曼光谱、反应能 | 3 次(反应能加热校正 5 次) |
| 构象搜索、二面角扫描、分子动力学、构象平均的极化率 | 5 次 |
| 蛋白质分子动力学 | 5 次(超过 20 ps 10 次) |
在线计算经 MolAstria 账号服务转发,按照模型许可要求遵守的出口管制规定,部分地区不能使用。提交的结构会缓存在站长电脑上以便复用结果,不记录你的其他信息。想在自己的电脑上算,用 Meta 页的脚本生成器,也可以用 MolAstria 桌面版。
想在自己的程序里调用这些模型(MACE 系列除外),用免费账号的 API key: 计算接口